Lula tinha dividido as competências da Funasa entre os ministérios da Saúde e das Cidades. O primeiro ficaria com o exercício de atividades relacionadas à vigilância em saúde e ambiente e o segundo com as demais atividades.
O relatório que saiu da comissão mista que analisou a medida provisória manteve o texto do goveno federal. No entanto, no plenário da Câmara, o PL apresentou o destaque de recriação da fundação, que ganhou apoio de parte expressiva dos partidos de centro. Um dos articuladores foi o deputado Danilo Forte (União-CE), que presidiu a fundação entre 2007 e 2010.
A recriação da Fundação Nacional da Saúde é, primeiramente, uma vitória para os brasileiros, sobretudo aqueles que residem nos pequenos e médios municípios – onde, pelo desenho original do governo, inevitavelmente ficariam sem acesso às mais essenciais políticas sanitárias”, afirmou, após a aprovação do destaque.
"É preciso que este episódio, com todas as dificuldades de articulação política e diálogo que vivemos, sirva como exemplo para a discussão das próximas políticas públicas no Congresso Nacional. Quando há diálogo, vence o Brasil", completou o deputado, em um recado à articulação do governo, que recebeu críticas de forma geral pelo Centrão.
Diante das controvérsias, o governo decidiu liberar a bancada para votar como quisesse em relação à recriação da fundação. O objetivo também foi facilitar a votação da medida provisória na Casa para permitir a análise do Senado antes de perder a validade.
O texto aprovado na Câmara foi apreciado no Senado sem apresentação de destaques. Por falta de tempo, a bancada governista abriu mão de fazer mudanças e chancelaram a decisão da Casa Baixa. O placar no Senado foi de 51 votos favoráveis ao texto, 19 contrários e 1 abstenção. A matéria precisa de sanção presidencial.
Funasa e escândalos de corrupção
Criada em 1990, a Funasa atuava na prevenção e combate à doenças, na educação em saúde, na atenção à saúde de populações carentes, sobretudo aquelas do Norte e Nordeste, no saneamento básico e no combate e controle de endemias, além da pesquisa científica e tecnológica voltadas para a saúde.
Ainda durante a transição do governo, os aliados de Lula discutiam a extinção da fundação por considerá-la absoleta. Além disso, a fundação se tornou um centro de denúncias de corrupção.
O último escândalo ocorre em 2022, quando a Controladoria Geral da União (CGU) e do Tribunal de Contas da União (TCU) descobriram indícios de sobrepreço de R$ 131 milhões em uma licitação no valor total de R$ 454 milhões para ligar poços de água no sertão nordestino.
Antes disso, em março de 2007, a coordenação da fundação no Maranhão foi acusado de gastar R$ 4,5 milhões em serviços de táxi para o transporte de índios que fazem tratamento médico fora das aldeias e das equipes multidisciplinares de saúde indígena.
